Categoría: Acuicultura

Uno de los descubrimientos más intrigantes de la era genómica es que solo una pequeña fracción del genoma está dedicada a la codificación de proteínas. La fracción restante de él contiene, entre otros elementos, una serie de transcritos no codificantes que regulan la transcripción de genes codificadores de proteínas.

En ese sentido, un estudio de Investigadores de la Agencia de Investigación Aplicada de Australia, (CSIRO, por su sigla en inglés), en colaboración con el Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR), demuestra el importante rol de los ARNs no codificantes en la regulación de la expresión de genes asociados a procesos infectivos en salmón del Atlantico.

La investigación liderada por la Dra. Francisca Samsing (CSIRO), junto a Dr. James W. Wynne (CSIRO), y la Dra. Pâmela A. Alexandre (CSIRO), en colaboración con Dra. Valentina Valenzuela-Muñoz (INCAR), Dr. Diego Valenzuela-Miranda (INCAR), Dr. Cristian Gallardo-Escárate (INCAR), describe la respuesta molecular de tejido branquial de salmón del Atlántico (Salmo salar) infectado con el ortomixovirus de la sardina (POMV), mediante redes de interacción mRNA-miRNAs.

Los científicos examinaron dos grupos de peces infectados por cohabitación con el virus POMV: grupo de exposición temprana 8 a 12 días después de la infección (dpi), para identificar potenciales biomarcadores de infección temprana e inmunidad innata. Lo que fue comparado con peces de exposición tardía, 19 dpi, para dilucidar potenciales marcadores de resistencia a POMV. Para ello, realizaron secuenciación de transcriptoma. De manera de identificar ARNs mensajeros expresados diferencialmente e identificar nuevos ARNs no codificantes largos (lncRNAs). Secuenciacion de smallRNAs encontrar microARNs diferencialmente expresados. Adicionalmente, mediante analisis de co-expresión y redes se pudo determinar genes y lncRNAs potencialmente modulados por miRNAs diferencialmente expresados durante la infección viral.

Los investigadores observaron que el grupo de microRNAs, miR-462/miR-731 específico de teleósteos, es altamente inducido en peces infectados con ortomixovirus. Además, se sugiere el posible uso de estos miRNAs como potencial biomarcador de infección viral temprana. Por otra parte, se observó disminución de la expresión del gen selenoproteína (selja), responsable del transporte de selenio, en peces de infección tardía (19 días post-infección). Los autores discuten que el cambio de expresión de este gen puede estar asociada con la eliminación viral y el regreso a la homeostasis después de la infección. Finalmente, se sugiere que la proteína selja tendría un rol relevante en peces durante una infección viral.

Revisa el paper “Competing endogenous RNA-networks reveal key regulatory microRNAs involved in the response of Atlantic salmon to a novel orthomyxovirus”, publicado en el Journal Developmental & Comparative Immunology.

https://doi.org/10.1016/j.dci.2022.104396

Figura 1: Características y perfiles de expresión génica del huésped de transcripciones codificantes (ARNm) y no codificantes (ARNlnc y miARN) en salmón del Atlántico subclínico (Salmo salar) desafiado con el ortomixovirus de la sardina (POMV). Distribución de longitud para (A) todos los ARNm ensamblados; (C) lncRNA predicho; y (E) miARN anotados. Diagramas de Venn para ARNm expresado diferencialmente (B); (D) lncRNA; y (F) miARN.

Circulogenoma: Transcripción del genoma completo en salmón del Atlántico infectado con POMV. El mapa de calor en rojo muestra la variación del índice de expresión del genoma cromosómico (CGE) entre el grupo de peces con respuesta temprana y tardía a la infección por POMV. Las cintas, en el diagrama de Circos, representan las regiones homólogas en el genoma del salmón.

¿Qué entendemos por basura?, ¿Cómo podemos sacar la basura del mar?, son algunas de las preguntas que forman parte del libro “Programa Educativo Reduciendo la contaminación por plástico en el Océano”, un programa piloto de educación ambiental dirigido a alumnos de cuarto año de enseñanza básica, diseñado e implementado en conjunto con la Secretaria Ministerial del Medio Ambiente de la Región del Biobío entre los años 2019 y 2020.

La contaminación por plástico en los océanos es uno de los principales problemas ambientales de nuestra época. Este problema tiene sus orígenes en la acción humana, donde la suma de esas acciones es responsable de un efecto negativo a escala global. Una de las formas de minimizar estos efectos negativos es a través de la educación ambiental. Esto es especialmente importante durante la niñez, donde se forman los valores y hábitos.

El principal objetivo del programa es incentivar la realización de acciones necesarias para evitar el uso del plástico en la vida diaria. Es por esto que incluye una serie de actividades para realizar en familia, para promover la transmisión de valores pro-ambientales desde los niños hacia sus padres. En este libro también se sistematizan los contenidos y actividades de cada una de las temáticas abordadas, como una guía para los docentes en su labor educativa.

El texto fue publicado por la editorial Universidad de Concepción y los autores son la Investigadora del Centro de Ecología Aplicada y Sustentabilidad (CAPES), y Directora del Centro NENRE-EfD Chile,Dra. Marcela Jaime y el Investigador Adjunto de la línea Sustentabilidad Socioeconómica del Centro INCAR, del Centro NENRE-EfD Chile, y del Centro de Estudios Ñuble, Dr. César Salazar, y la Profesora de educación general básica del Instituto Profesional de Providencia, Paola Buchholz.

Esta primera edición del libro tiene una versión impresa con 90 páginas y también tiene su versión digital donde puede ser descargada de manera gratuita. Revisa el texto en el siguiente link:

https://editorial.udec.cl/?q=node/159.

La integrante del Programa Integrativo del Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR) y actual estudiante del Doctorado en Ciencias de la Acuicultura de la Universidad Austral de Chile (UACH) Sede Puerto Montt, Dra. (c) Stefany Camelo-Guarín, realizó el muestreo para su tesis “Relación trófica espacial y temporal entre mitílidos y salmónidos: bases para avanzar en la implementación del Enfoque Ecosistémico a la Acuicultura”.

De acuerdo a la investigadora, “el objetivo del estudio es evaluar la existencia de una relación trófica (emisión y aprovechamiento de nutrientes) entre cultivos intensivos de salmónidos y choritos, considerando la posible influencia de la variación espacial y temporal de las características hidrográficas y ambientales en la región de Los Lagos en el sur de Chile”, explicó la Dra.(c) Camelo-Guarín.

Entre los objetivos específicos de la investigación están:

– Evaluar el efecto de la cercanía de las cuelgas de choritos a una granja de salmónidos sobre el rendimiento y calidad nutricional de estos moluscos filtradores.

– Evaluar la transferencia directa e indirecta de nitrógeno (N), carbono (C) y azufre (S) desde granjas de salmónidos hacia granjas de choritos.

– Evaluar la influencia de las características hidrográficas y ambientales, sobre la posible relación trófica (transferencia y reutilización de nutrientes) entre granjas de choritos y salmónidos.

– Proponer estrategias de gestión espacial y productiva para potenciar la integración trófica de la acuicultura a nivel de paisaje que permita avanzar en la implementación del Enfoque Ecosistémico a la Acuicultura.

Para llevar a cabo los objetivos se requiere del apoyo de un equipo multidisciplinario de investigadores y técnicos, el cual incluye a Katherine Espinoza, Manuel Díaz y Cesar Salgado, y por parte de la Universidad Austral de Chile; además de Patricio Díaz, Camila Schwerter, Robinson Altamirano e Ivan Perez-Santos, por el lado del Centro I-mar de la Universidad de Los Lagos; y los Investigadores del Programa Integrativo del Centro INCAR, Dr. Carlos Molinet, y la Dra. Doris Soto.

“Cada muestreo requiere hacer una detallada evaluación de las corrientes en distintos momentos de la marea, análisis de condiciones oceanográficas de la columna de agua en sectores estratégicos, muestreo de los choritos en puntos cercanos y lejanos de las granjas de salmones y un muestreo de alimento y fecas de salmones. Además, se colectan muestras de agua para analizar nutrientes en el fitoplancton y seston en una grilla espacial acorde con el diseño muestral”, explicó la Dra.(c) Camelo-Guarín.

La campaña se realizó en el canal Chidhuapi (Isla Chihuapi), Isla Guar, en la Región de Los Lagos, entre los días 10 y 11 de marzo. A la fecha se han realizado dos campañas, de un total de cuatro. El procesamiento de las muestras y análisis de los datos permitirá obtener resultados parciales antes del siguiente muestreo que está programado para el otoño de 2022.

El muestreo se realiza con el apoyo de las embarcaciones de investigación “Doctor Jürgen Winter”, de la Universidad Austral de Chile, y la embarcación “Doña Isidora”, de la Universidad de Los Lagos.

En el trabajo que será presentado para optar a su grado de Doctora en Ciencias de la Acuicultura UACh participan las empresas CERMAQ, la Sociedad Servicios Acuícolas Mimar del Sur Ltda., Granjamar S.A. y Apiao S.A., además de un centro recolector de semillas en Isla Guar. Por parte de la academia colaboran el Instituto de Acuicultura (Programa de Investigación pesquera) de la Universidad Austral de Chile, el Centro INCAR (Programa Integrativo), el i-mar (OMARE) de la Universidad de los Lagos y el Stable Isotope Ecology Laboratory & UA Stable Isotope Facility (UASIF) de la Universidad de Antofagasta.

*La investigación doctoral busca establecer bases para avanzar en la implementación del Enfoque Ecosistémico a la Acuicultura (equilibrio entre los objetivos ambientales, económicos, sociales y de gobernanza) a través de la implementación de sistemas multitróficos integrados a escala de paisaje.

Stefany Camelo-Guarín, investigadora y actual estudiante del Doctorado en Ciencias de la Acuicultura de la Universidad Austral de Chile Sede Puerto Montt, apoyada también por el Centro INCAR lideró el 10 y 11 de marzo el muestreo para su tesis doctoral en  el canal Chidhuapi (Isla Chihuapi), Isla Guar, en la Región de Los Lagos, Chile.

Esta actividad constituye la segunda campaña de recolección de muestras para la tesis titulada “Relación trófica espacial y temporal entre mitílidos y salmónidos: bases para avanzar en la implementación del Enfoque Ecosistémico a la Acuicultura”.

Según indicó la profesional, el trabajo que será presentado para optar a su grado de Doctora en Ciencias de la Acuicultura UACh tiene por objetivo evaluar la existencia de una relación trófica (emisión y aprovechamiento de nutrientes) entre cultivos intensivos de salmónidos y choritos, considerando la posible influencia de la variación espacial y temporal de las características hidrográficas y ambientales en la región de Los Lagos en el sur de Chile.

Los específicos de la investigación incluyen:

• Evaluar el efecto de la cercanía de las cuelgas de choritos a una granja de salmónidos sobre el rendimiento y calidad nutricional de estos moluscos filtradores.

• Evaluar la transferencia directa e indirecta de nitrógeno (N), carbono (C) y azufre (S) desde granjas de salmónidos hacia granjas de choritos.

• Evaluar la influencia de las características hidrográficas y ambientales, sobre la posible relación trófica (transferencia y reutilización de nutrientes)  entre granjas de choritos y salmónidos.

• Proponer estrategias de gestión espacial y productiva para potenciar la integración trófica de la acuicultura a nivel de paisaje que permita avanzar en la implementación del Enfoque Ecosistémico a la Acuicultura.

“Este es un proyecto de colaboración entre la industria y la academia. Las empresas CERMAQ y MOWI colaboran con el proyecto por parte de la salmonicultura y por parte de la mitilicultura colaboran la Sociedad Servicios Acuicolas Mimar del Sur Ltda., Granjamar S.A. y Apiao S.A., además de un centro recolector de semillas en Isla Guar ”, partió indicando Stefany Camelo-Guarín.

“Como parte de la academia, colaboran el Instituto de Acuicultura (Programa de Investigación pesquera) de la Universidad Austral de Chile, el Centro INCAR (Programa Integrativo), el i-mar (OMARE) de la Universidad de los Lagos y el Stable Isotope Ecology Laboratory & UA Stable Isotope Facility (UASIF) de la Universidad de Antofagasta”, añadió.

Cada muestreo requiere hacer una detallada evaluación de las corrientes en distintos momentos de la marea, análisis de condiciones oceanográficas de la columna de agua en sectores estratégicos, muestreo de los choritos en puntos cercanos y lejanos de las granjas de salmones y un muestreo de alimento y fecas de salmones. 

Además, se colectan muestras de agua para analizar nutrientes en el fitoplancton y seston en una grilla espacial acorde con el diseño muestral. 

Para llevar a cabo los objetivos se requiere del apoyo de un equipo multidisciplinario de investigadores y técnicos, el cual ha incluido a Katherine Espinoza, Manuel Díaz, Carlos Molinet, Cesar Salgado y Stefany Camelo-Guarín, por parte de la Universidad Austral de Chile; además de Patricio Díaz, Camila Schwerter, Robinson Altamirano e Ivan Perez-Santos, por el lado del Centro I-mar de la Universidad de Los Lagos; y la Dra. Doris Soto, del Centro INCAR. 

El muestreo se realiza con el apoyo de las embarcaciones de investigación “Doctor Jürgen Winter”, de la Universidad Austral de Chile, y la embarcación “Doña Isidora”, de la Universidad de Los Lagos.

A la fecha se han realizado dos campañas, de un total de cuatro campañas estacionales. El procesamiento de las muestras y análisis de los datos permitirá obtener resultados parciales antes del siguiente muestreo que está programado para el otoño de 2022. 

Un reciente estudio desarrollado por los Investigadores del Centro INCAR determinó que la tiamulina, un antimicrobiano de uso exclusivo veterinario y clasificado como “menos importante” por la Organización Mundial de la Salud, es una alternativa viable al florfenicol, el antimicrobiano, más empleado en el control de las patologías de salmónidos, incluyendo el tratamiento contra la tenacibaculosis causada por Tenacibaculum dicentrarchi, la tercera infección bacteriana más importante de la salmonicultura en Chile.

El estudio de los Investigadores de la línea “Salud animal en estadios de vida de agua dulce de salmónidos” del Centro INCAR y de la Universidad Andrés Bello, Dr. Ruben Avendaño-Herrera y la Ingeniera Rute Irgang, se desarrolló dentro del Proyecto FONDECYT 1190283. Para ello, se analizó la susceptibilidad a la tiamulina de 32 aislados chilenos de T. dicentrarchi y la cepa tipo de la bacteria CECT 7612^T usando el método de determinación de las concentraciones inhibitorias mínimas (MIC) por micro dilución según los procedimientos recomendados por el Clinical and Laboratory Standard Institute, pero fijando la temperatura de incubación a 18 ºC.

“La génesis del estudio se sustentan en que los valores de MIC a florfenicol de los aislados de T. dicentrarchi en un estudio previo se fijaron en 2 μg/mL, lo que es una concentración bastante alta y se requiere tener alternativas cuando los aislados comiencen a disminuir la susceptibilidad a este antimicrobiano. Por tanto, decidimos estudiar la tiamulina debido  que es de uso exclusivo médico veterinario y que por estudios previos conocíamos de sus buenos resultados para T. dicentrarchi.” expresó el Dr. Avendaño-Herrera.

“Nuestros resultados in vitro presentados sugieren que la tiamulina es una alternativa viable al florfenicol, específicamente porque la tiamulina requiere concentraciones comparativamente más bajas para inhibir T. dicentrarchi. Además, considerando aspectos farmacocinéticos/farmacodinámicos se requeriría menos cantidad de tiamulina en el alimento para controlar los brotes de tenacibaculosis. Cabe destacar que este antimicrobiano ha sido empleado en campo mediante el formato de extra-etiqueta”, explicaron los expertos del Centro INCAR.

En Chile, la tiamulina está registrada para su administración en cerdos, pollos de engorde, pavos y aves. Los investigadores recomiendan solicitar a las empresas farmacéuticas que registren la tiamulina para salmónidos y proporcionen tratamientos antimicrobianos alternativos para la industria de los salmónidos.

“La idea de esta investigación no es fomentar el uso de antimicrobiano, sino contar con alternativas y el uso de estos compuestos debe ser siempre considerando los valores de MIC de los aislados que son causantes de las infecciones”, finalizó el Dr. Avendaño-Herrera.

Revisa el estudio “Evaluación de la susceptibilidad in vitro de Tenacibaculum dicentrarchi a la tiamulina mediante pruebas de concentración mínima inhibitoria”, pubicado por el “Journal of Fish Diseases” aquí.

https://doi.org/10.1111/jfd.13604

La actividad se realiza en las localidades de Yates y Cochamó y, forma parte de la iniciativa titulada “Evaluación de la eficiencia de colectores y condición de bancos aledaños: proyectando escenarios de variabilidad climática”.

El Programa de Investigación Pesquera de la Universidad Austral de Chile Sede Puerto en conjunto con el Instituto de Fomento Pesquero (IFOP) y Centro INCAR realizaron la primera salida a terreno del presente año a bordo de la emblemática embarcación de investigación Jurgen Winter.

La expedición que se realiza en las localidades de Yates y Cochamó, en la región de Los Lagos, forma parte de la iniciativa titulada “Evaluación de la eficiencia de colectores y condición de bancos aledaños: proyectando escenarios de variabilidad climática”.

Según indicaron desde el equipo de trabajo, el objetivo general de este proyecto es diseñar y aplicar un indicador de la salud de los bancos naturales de mitílidos en zonas donde se realiza la actividad de captación de semillas en el fiordo Reloncaví bajo

escenarios de variabilidad climática.

En lo que respecta a los objetivos generales, en tanto, estos se centrarán en:

• Identificar y cuantificar la presencia de reclutas en bancos naturales de mitílidos aledaños centros de captación de semillas y donde IFOP monitorea larvas y asentamiento.

• Comparar el éxito de captación en sustrato artificial con el éxito de reclutamiento en bancos.

• Obtener muestras de plancton complementarias al muestreo de IFOP entre el sistema de cultivo y la costa (banco).

• Establecer patrones de correlación con variables ambientales en particular salinidad.

ANTECEDENTES A CONSIDERAR

La mitilicultura es una actividad que depende de la captación de semilla desde  bancos naturales de mejillones, y es posible que en la actualidad exista una sobreexplotación de los bancos debido a la “captura” de la semilla.

El cambio climático global, y particularmente la reducción de precipitaciones estarían modificando y reduciendo el hábitat para los bancos de M. chilensis, con lo cual a su vez se reduciría su capacidad de producir semilla.

Paralelamente, se espera que la disminución del espesor de la picnoclina en la columna de agua implique la disminución del espacio/volumen para la instalación de colectores, además de permitir el éxito de especies competidoras en los colectores (ej. cholga).

Dentro de este contexto, se vuelve fundamental diseñar y monitorear un indicador de salud ecosistémica de la actividad de captación de semillas relativa a los bancos de reproductores circundantes.

Lo óptimo es que el indicador considere tanto el reclutamiento en bancos naturales como el éxito de captación de semilla (probabilidad de reclutamiento) para así estimar cuánta semilla queda disponible para mantener los bancos naturales luego de la captación.

Descubrir el desplazamiento de Galaxias maculatus (puye) y evaluar los patrones de movimiento a través de análisis en el hueso del oído interno del pez, fue el trabajo realizado para conocer su historia de vida y hábitats relacionados.

“Desempaquetando la complejidad de los patrones de movimiento longitudinal de pez anfídromo facultativo e implicaciones para el reclutamiento poblacional” es el nombre del estudio realizado por Rodrigo Ramírez, estudiante del Doctorado en Ciencias con mención en Biodiversidad y Biorecursos, perteneciente a la Facultad de Ciencias de la Universidad Católica de la Santísima Concepción (UCSC). Los directores de la tesis son los académicos Dr. Sergio Contreras (UCSC), Konrad Górski (UACh) y Townsend Peterson (KU); la investigación correspondiente a un capítulo de la tesis financiada por el proyecto Fondecyt 11180545 fue recientemente publicada en la revista Scientific Reports.

Estudiar los patrones de movimiento del pez Galaxias maculatus y entender su variabilidad fue el principal objetivo del estudio. “Es un pez muy particular, ya que tiene una migración facultativa. Esto quiere decir que algunas poblaciones presentan migración diádroma, donde sus individuos se trasladan entre agua dulce y agua salada. Sin embargo, otras poblaciones pueden prescindir de la migración y constituir poblaciones residentes. Para que ocurra eso, es necesario estudiar los factores ecológicos que permiten mantener esta residencia en un determinado lugar”, explicó Rodrigo Ramírez.

Para averiguar estos factores, se analizó la composición química de los huesos del oído interno de los peces (otolitos). A través de diversas técnicas se evaluó el trayecto y las características de los hábitats por donde se desplazó el pez. “Utilizando ablación por láser se perforó en los otolitos a lo largo de un transecto desde el borde hasta el núcleo en cada pez y posteriormente utilizando análisis de partición recursiva se dividió la señal química a lo largo del transecto en particiones. Finalmente, mediante métodos de aprendizaje automatizado designamos la ubicación geográfica de cada partición para reconstruir el movimiento de los peces a lo largo de cada sistema fluvial”, complementó Rodrigo Ramírez.

Principales resultados

El desafío de este trabajo está en intentar rastrear el movimiento a muy baja resolución espacial. En el otolito se encuentra una historia química del pez. Por medio de un método de perforación láser, se extrae la composición química de diversos lugares en los que el pez habitó durante su vida. Con esta información y su asociación al espacio geográfico, es posible determinar el trayecto de recorrido. Cabe destacar que las muestras corresponden a la Región de los Ríos, de Los Lagos y de la Araucanía, entre los años 2019 y 2020, tomadas en las cuatro estaciones del año. 

La investigación determinó patrones de movimiento distintos en la zona estudiada en comparación al lugar de origen del pez, que es Australia. “Existe una mayor cantidad de poblaciones residentes y menos poblaciones diádromas. Es decir, encontramos una mayor cantidad de poblaciones residentes (95%), principalmente dulceacuícolas, las cuales, han prescindido de la migración para completar su ciclo de vida”, comentó el estudiante UCSC. Este es un hecho interesante debido a que la pérdida de diadromía requiere de la interacción de diversas características ecológicas determinantes para el ciclo de vida del pez. 

Considerando estas características ecológicas, el estudio sugiere que el reclutamiento de peces residentes dulceacuícolas, ocurre en aquellos ríos que presentan zonas de baja pendiente en sus tramos altos. En estas áreas se presentan las condiciones adecuadas de reclutamiento de la especie y así establecer mayormente residencia. El pez recluta en estas zonas porque entre otras cosas, estos hábitats permiten retener las larvas y los nutrientes necesarios para su alimentación, de tal manera que, el reclutamiento en el estuario, característica ancestral de este pez migratorio, pasa a un segundo plano.

Finalmente, parte de la importancia de esta especie radica en aspectos biológicos, económicos y culturales. En primer lugar, su amplia distribución en el hemisferio sur y su pasado histórico, la convierten en un excelente modelo biológico para evaluar hipótesis biogeográficas. “Es la especie de pez de agua dulce con la mayor distribución en el mundo”, enfatizó Rodrigo Ramírez. 

Asimismo, representa un recurso eco-sistémico importante al sur del país, dado que es un elemento culinario importante en la alta cocina o cocina gourmet. Finalmente, el puye tiene un valor cultural para algunos pueblos al sur de Chile por su pesca  tradicional. 

El Investigador Asociado de la línea Genómica Acuícola del Centro INCAR, Dr. Gustavo Núñez-Acuña, ha sido nombrado Editor líder para el Research Topic: “Genomics Applied to the Understanding of Host-Parasite Interactions and Anti-Parasite Treatments in Marine Species” (“Genómica aplicada a la comprensión de las interacciones huésped-parásito y tratamientos antiparasitarios en especies marinas”) del Journal Frontiers in Marine Science. Este Research Topic será coordinado por el Dr. Núñez en conjunto con el reconocido investigador de la Universidad de Stirling, Dr. Armin Sturm.

“Este tema de investigación se centrará en estudios que utilicen aproximaciones genómicas para avanzar en la comprensión de aspectos clave de la biología de los parásitos marinos y sus interacciones con las especies hospedero y el medio ambiente marino. Se espera que los estudios genómicos proporcionen información valiosa sobre la genética de las poblaciones de ectoparásitos marinos y su adaptación fisiológica y genética a los tratamientos antiparasitarios. Además, los estudios genómicos comparativos tienen el potencial de identificar vías genéticas específicas para grupos de parásitos de interés, lo que facilita la identificación de posibles objetivos de fármacos o vacunas”, explicó el Investigador del Centro INCAR.

Entre los temas que se pueden abordar, aunque no de forma excluyente, están los siguientes:

• Nuevos ensamblajes de genomas completos de especies de parásitos marinos que afectan a especies hospedera en sistemas acuícolas o poblaciones silvestres, incluyendo estudios genómicos comparativos.

• Evaluaciones a nivel del genoma de los cambios en la expresión génica, en secuencias genómicas o en la estructura de la cromatina relacionados con la reducción de la sensibilidad de los parásitos marinos a los tratamientos farmacológicos o no farmacológicos.

• Estudios genómicos de poblaciones de parásitos marinos y asociación de marcadores genéticos con factores ambientales locales y relacionados con el tratamiento.

• Caracterización del mecanismo de acción de nuevos tratamientos farmacológicos y no farmacológicos en el control de ectoparásitos marinos a nivel genómico.

• Inmunomodulación del parásito de las respuestas del huésped, susceptibilidad del huésped a la modulación de las respuestas inmunitarias de los parásitos.

El primer plazo para enviar las propuestas son los siguientes:

Resúmenes (abstract): 03 de mayo de 2022.

Manuscrito: 02 de julio de 2022.

El envío puede realizarse al correo del Investigador gustavonunez@udec.cl.

Los Reserach Topic de Frontiers in Marine Science son colecciones de artículos revisados ​​por pares sobre temas de investigación de vanguardia. Definidos, administrados y dirigidos por investigadores de renombre, unen a los principales expertos del mundo en torno a los temas más candentes, estimulando la colaboración y acelerando la ciencia.  

Administradas y difundidas en la plataforma Open Science personalizada de Frontiers, estas colecciones son de libre acceso y muy visibles, lo que aumenta el número de lectores y las citas para su investigación. 

Mas detalles aquí:

https://www.frontiersin.org/research-topics/34819/genomics-applied-to-the-understanding-of-host-parasite-interactions-and-anti-parasite-treatments-in#overview

El proyecto permitirá investigar el desarrollo del bioproceso del sedante para su uso en el transporte de salmónidos y otros peces.

Los resultados del X Concurso de Investigación Tecnológica de la ANID posicionaron a la Universidad de Concepción como la institución con mayor número de adjudicaciones. “Hakafish: formulación sedante de origen microalgal para el transporte de salmónidos en condiciones operacionales reales” es una de las adjudicaciones UdeC de un total de 27 proyectos a nivel nacional.

Con el financiamiento otorgado por la ANID se podrá optimizar el cultivo de la microalga “Heterosigma akashiwo”, hasta ahora validada en escala de laboratorio, como formulación natural sedante, sin efectos secundarios en peces, para su uso en la acuicultura, actividad económica que exige altos estándares de calidad para su comercialización. 

El proyecto está a cargo de la Dra. Allisson Astuya Villalón, académica del Departamento de Oceanografía de la Facultad de Ciencias Naturales y Oceanográficas y directora del Laboratorio de Biotoxinas UdeC. El equipo está integrado además por el Dr. (c) Nicolás Troncoso León, director alterno del proyecto; Dra. Alejandra Llanos Rivera, investigadora y académica del Departamento de Oceanografía UdeC; Dr. Cristian Agurto Muñoz, investigador; Alejandra Rivera Latorre y Sandra Jara Toro, Ingenieras en Biotecnología Marina y Acuicultura UdeC.

Asociados con Gibmar, Grupo Interdisciplinario de Biotecnología Marina, identificaron la necesidad de mejorar el bienestar en los peces para actividades asociadas al ciclo productivo, como en el traslado, disminuyendo el estrés a través del uso de sedantes o anestésicos. “Nuestro primer antecedente fue la demostración de la posibilidad de anestesiar a peces, principalmente salmónidos, sin inducir efectos secundarios en ellos. Para esta segunda etapa el objetivo es crear un producto para su uso en la etapa del transporte para evitar el estrés de los peces” explica la Dra. Allisson Astuya, directora del proyecto.

Como el manejo de ciclo de producción es altamente estresante para los peces, el objetivo es poder validar el sedante para que pueda ser utilizado en condiciones de transporte reales, lo cual permitirá mejorar la producción, mejorar las condiciones para el manejo de las especies y tendrá beneficios en la calidad del producto final de consumo humano.

Con una tesis que investigó el estatus sanitario del Mytilus chilensis, también conocido como Mejillón chileno o “chorito” en poblaciones naturales y en cultivo intensivo, el Integrante de la línea “Salud animal en ambiente marino” del Centro INCAR, Dr. Pablo Santibáñez, obtuvo su grado de Doctor en Ciencias de la Acuicultura, de la Universidad Austral de Chile, sede Puerto Montt.

El nuevo doctorado, aprobó exitosamente su examen de grado, con su tesis “Búsqueda en Mytilus chilensis de enfermedades y de patógenos relevantes pertenecientes a la lista de enfermedades de notificación obligatoria a la Organización Mundial de Sanidad Animal (OIE)”.

“Este es el primer estudio que compara individuos de cultivo intensivo, comparándolos con individuos provenientes de áreas libres de acuicultura. Al considerar un grupo alejado de las áreas de producción intensiva, nos permitió evaluar, como estudio puntual, que las poblaciones tienen diferencias significativas en la composición de sus microbiomas, lo que debe ser evaluado en profundidad para determinar posibles factores de riesgo para la industria mitilicultora”, explicó el Doctor en Ciencias de la Acuicultura, Pablo Santibáñez.

Si bien, para M. chilensis, los análisis de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) resultaron negativos para la detección de patógenos de alto riesgo de notificación obligatoria a la OIE y SERNAPESCA, “este estudio, de forma interesante, muestra que en ambientes con alta producción primaria, la diversidad de especies en el microbioma es menor, lo que es un factor de riesgo para la especie en estudio, ya que microbiomas saludables (eubiosis), contribuyen de forma significativa en diferentes ámbitos, como el potenciar y/o modular la respuesta sistema inmune, complementar el pool genético de la especie para contribuir a rutas metabólicas parcialmente presentes, crecimiento, reproducción, entre otros. En la presencia de agentes estresores bióticos o abióticos, la comunidad microbiana puede desbalancearse (disbiosis) desde microrganismos comensales a patógenos, lo que puede generar enfermedades y mortalidades en la especie”, añadió el Investigador del Centro INCAR.

“Los individuos analizados carecen de hallazgos histopatológicos significativos que afecten el normal funcionamiento de los tejidos. Los microbiomas establecidos a partir del análisis del gen 16S rDNA, muestran diferencias significativas entre las poblaciones estudiadas, así los individuos de cultivo intensivo presentan una baja diversidad de especies comparado con los individuos de bancos naturales, presentando una sobrerrepresentación importante de bacterias del género Vibrio, lo que puede tener impactos futuros en la sustentabilidad de la industria, en contexto de cambio climático, donde la presencia de factores bióticos o abióticos pueden generar una disbiosis de la composición natural de la microbiota de las especies marinas”, especifica el estudio.

Adicionalmente, la investigación analizó la composición de la comunidad eucariótica asociada al intestino de M. chilensis a través de análisis de metabarconding del gen 18S rDNA, se observa baja diversidad de especies en los individuos provenientes de centros de cultivo comparado con los de poblaciones naturales, destacando en ambos grupos una alta proporción de secuencias que no pudieron ser asignadas taxonómicamente (῀20%). 

Finalmente, los análisis microbiológicos para evaluar la inocuidad alimentaria de este recurso bentónico resultaron negativos a la presencia de Salmonella spp. y Vibrio parahaemolyticus, con recuentos de E. coli por debajo de los limites normativos, estableciendo un alto nivel de seguridad alimentaria para las muestras analizadas. 

Paper “First characterization of the gut microbiome associated with Mytilus chilensis collected at a mussel farm and from a natural environment in Chile”.

Autores: P. Santibáñez, J. Romalde, J. Maldonado, D. Fuentes, J. Figueroa.

https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2021.737644

Fotografías: Dr. Carlos Molinet, Programa Integrativo del Centro INCAR.